MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	AAAT	2	8	10	17	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020239	T	6	6	95	100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020239	GTATAT	2	12	384	395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020239	T	6	6	397	402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020239	T	6	6	412	417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020239	TAT	2	6	425	430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020239	TA	3	6	520	525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020239	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020239	TAAT	2	8	577	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020239	AT	3	6	583	588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020239	TA	3	6	598	603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020239	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020239	ATA	2	6	611	616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020239	TCCT	2	8	649	656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020239	AGA	2	6	681	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020239	CAT	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020239	TAA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020239	TAAT	2	8	773	780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020239	ATT	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020239	ATT	2	6	796	801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020239	ATA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020239	AATA	2	8	857	864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020239	GGT	2	6	902	907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020239	A	6	6	2458	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020239	TTCT	2	8	2469	2476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020239	AGCT	2	8	2481	2488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020239	T	6	6	2502	2507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020239	A	7	7	3946	3952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020239	A	7	7	4092	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020239	T	6	6	4111	4116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020239	TCC	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020239	TATT	2	8	8015	8022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020239	ATTTAT	2	12	8055	8066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020239	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020239	TGT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020239	ATT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020239	T	6	6	8108	8113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020239	A	7	7	8118	8124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020239	AAT	2	6	8144	8149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020239	AT	3	6	8151	8156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020239	T	6	6	8164	8169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020239	AAT	2	6	8823	8828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020239	ATA	2	6	8845	8850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020239	AAATA	2	10	8856	8865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020239	ATT	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020239	T	7	7	9185	9191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020239	TCC	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020239	T	6	6	9631	9636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020239	T	6	6	9660	9665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020239	AT	3	6	9670	9675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020239	A	6	6	9719	9724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020239	T	6	6	9730	9735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020239	AC	3	6	9744	9749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020239	AT	4	8	9761	9768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020239	TA	3	6	9774	9779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020239	AAT	2	6	9782	9787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020239	T	7	7	9796	9802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020239	A	7	7	9820	9826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020239	TAA	2	6	10483	10488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020239	TA	3	6	10498	10503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020239	ATT	2	6	10508	10513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020239	ATTT	2	8	10529	10536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020239	TAA	2	6	10603	10608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020239	GAA	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020239	TAA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020239	AT	3	6	10703	10708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020239	AAT	2	6	10721	10726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020239	ACT	2	6	10757	10762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020239	AGA	2	6	10839	10844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020239	A	6	6	11049	11054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020239	CTAT	2	8	11068	11075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020239	CAC	2	6	12788	12793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020239	AAT	2	6	14782	14787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020239	T	7	7	19370	19376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020239	CTCC	2	8	19618	19625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_020239	ATA	2	6	19649	19654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020239	TAAA	2	8	19663	19670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020239	GATT	2	8	19692	19699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020239	TTA	2	6	19738	19743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020239	ATT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020239	TAA	2	6	19820	19825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020239	CCTTC	2	10	19875	19884	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020239	A	6	6	20008	20013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020239	ACT	2	6	20091	20096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020239	AATT	2	8	20588	20595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020239	TAA	2	6	20612	20617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020239	AGG	2	6	20638	20643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020239	GTA	2	6	20863	20868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020239	A	7	7	20918	20924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020239	AATT	2	8	20967	20974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020239	CAA	2	6	22301	22306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020239	GCC	2	6	22339	22344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020239	CTA	2	6	22351	22356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020239	GCT	2	6	22378	22383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020239	TC	3	6	22530	22535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020239	A	7	7	22544	22550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020239	AGT	2	6	22577	22582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020239	A	6	6	22862	22867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020239	TTA	2	6	22868	22873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020239	TCT	2	6	23237	23242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020239	TGT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020239	AAG	2	6	23271	23276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020239	TA	3	6	23280	23285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020239	GAA	2	6	23291	23296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020239	GCATTA	2	12	23368	23379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020239	A	6	6	23488	23493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020239	GTA	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020239	T	6	6	23541	23546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020239	A	6	6	23559	23564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020239	T	7	7	23589	23595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020239	TGA	2	6	23641	23646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020239	TCA	2	6	23647	23652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020239	ATAA	2	8	23701	23708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020239	ATA	2	6	23720	23725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020239	CCCA	2	8	23763	23770	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_020239	A	6	6	25145	25150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020239	CCT	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020239	CT	3	6	25188	25193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020239	TA	3	6	25226	25231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020239	ACAA	2	8	25248	25255	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020239	AGA	2	6	25261	25266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020239	AATTA	2	10	25271	25280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020239	ATA	3	9	25281	25289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020239	AG	3	6	25296	25301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020239	CTT	2	6	25333	25338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020239	T	7	7	25337	25343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020239	T	7	7	25347	25353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020239	T	6	6	25357	25362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020239	TGT	2	6	25374	25379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020239	T	7	7	25379	25385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020239	A	6	6	25388	25393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020239	TTG	2	6	25446	25451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020239	T	7	7	25465	25471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020239	GTG	2	6	25479	25484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020239	A	6	6	25485	25490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020239	TGG	2	6	25505	25510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020239	GTT	2	6	27162	27167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020239	ATC	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020239	ACA	2	6	27191	27196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020239	AAATA	2	10	27197	27206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020239	T	6	6	27218	27223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020239	A	6	6	27278	27283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020239	ATT	2	6	27325	27330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020239	ATA	2	6	27361	27366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020239	ATTT	2	8	27368	27375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020239	TAT	2	6	27382	27387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020239	TA	3	6	27393	27398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020239	TTTA	2	8	27413	27420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020239	T	6	6	27421	27426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020239	TAA	2	6	27428	27433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020239	TTTGT	2	10	27461	27470	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020239	T	6	6	27486	27491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020239	GGCGTG	2	12	27550	27561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_020239	A	6	6	27633	27638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020239	CTA	2	6	27648	27653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_020239	T	6	6	27670	27675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_020239	ATTT	2	8	28126	28133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020239	T	9	9	28153	28161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_020239	TTG	2	6	30120	30125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_020239	GAAT	2	8	35336	35343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020239	AGT	2	6	39586	39591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_020239	TTG	2	6	39712	39717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_020239	T	7	7	69732	69738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020239	GGTAT	2	10	69745	69754	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.